Además del mantenimiento y conservación de las redes e instalaciones de agua potable, aqualia se encarga del mantenimiento, limpieza y conservación de las redes del alcantarillado.

Existen dos instalaciones de bombeo de aguas residuales: la Estación de bombeo I, situada en la Plaza del Ángel compuesta por tres bombas que recogen el agua del casco urbano y la impulsan hasta la Estación de bombeo II, situada en la Serna, que cuenta también con tres bombas que, a su vez, impulsan el agua hasta Salamanca para su depuración.